А в концентрационных лагерях, тем временем, проводились медицинские эксперименты под эгидой СС. Эксперименты, не имеющие ничего общего с человеческой моралью, Гиммлер оправдывал полностью. Он писал Рашеру, «ведущему специалисту» в данном направлении деятельности:
«Я считаю повинными в государственной измене тех, кто даже сегодня отвергает эксперименты на людях и допускает вместо этого смерть отважных немецких солдат… Я без колебаний предъявлю обвинение этим людям».
Непосредственное участие Гиммлера в этой «работе» доказывают сохранившиеся письма и записки. Основные эксперименты велись в период с 1941 по 1944 год. Но начались они в начале 1939 года, когда Гиммлер дал согласие на то, чтобы применять к заключенным иприт и фосген.