А в концентрационных лагерях, тем временем, проводились медицинские эксперименты под эгидой СС. Эксперименты, не имеющие ничего общего с человеческой моралью, Гиммлер оправдывал полностью. Он писал Рашеру, «ведущему специалисту» в данном направлении деятельности:

«Я считаю повинными в государственной измене тех, кто даже сегодня отвергает эксперименты на людях и допускает вместо этого смерть отважных немецких солдат… Я без колебаний предъявлю обвинение этим людям».

Непосредственное участие Гиммлера в этой «работе» доказывают сохранившиеся письма и записки. Основные эксперименты велись в период с 1941 по 1944 год. Но начались они в начале 1939 года, когда Гиммлер дал согласие на то, чтобы применять к заключенным иприт и фосген.

Из «Мемуаров» Вальтера Шеленберга:

«Организация СС была построена Гиммлером по принципам Ордена иезуитов. Служебный устав и духовные упражнения, представленные Игнатием Лойолой, представляли собой образец, который Гиммлер усердно старался скопировать»

Гиммлер действительно вообразил себя Великим Магистром Ордена, который он же и намеревался создать из солдат СС. Ордена, который был призван избавить нордические расы от проникновения еврейской и славянской крови. Как сказал он сам в 1936 году, «мы позаботимся, чтобы в Германии, сердце Европы, никогда больше не вспыхнула еврейско-большевистская революция, организованная здесь или привнесенная шпионами из-за рубежа».

Под орден был построен замок Вевельсбург, в лесах Вестфалии, а Гиммлер стал и антикатоликом и антихристианином. Теперь рейхсфюрер СС поклонялся народным суевериям, астрологии и прочей мистике, основал институт «Наследие предков» — Ананербе – занялся изучение рун, медитациями и прочим.